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Antibióticos que actúan sobre los ácidos nucleicos. Quinolonas. Rifamicinas. Luciana Roperti Deguisa, Héctor A. Serra

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Antibióticos que actúan sobre los ácidos nucleicos. Quinolonas. Rifamicinas. Luciana Roperti Deguisa, Héctor A. Serra Norfloxacina, Ciprofolxacina, Ofloxacina, Norfloxacina, Ciprofolxacina, Moxifloxacina, rifamicina B, rifamicina SV y rifampicina.

HA Serra //

HA Serra // AntibióticosFigura 4. Papel de la topoisomerasa IV en la división celular. La duplicación de los cromosomasbacterianos genera moléculas de DNA enredadas entre sí, llamadas catenanos incapaces demigrar a cada célula hija. Su separación previa a la división, la decatenación, está catalizadapor la topoisomerasa mencionada.ReplicaciónCatenano(cromosomas hijos juntos)Avance de lahorquilla (mayortensión)GirasaHelicasaComplejopolimerasaDecatenaciónCatenaciónComplejopolimerasaDNA anudado(catenano)Dúplex individuales(cromosomas separados)Topoisomerasa IVFigura 5. Esquema mostrando la estructura de la RNA polimerasa bacteriana. A la izquierda,esquema que muestra los sitios de unión de la enzima al DNA. Al centro, enzima posicionadasobre el promotor con ayuda de la subunidad . Se ve como la polimerasa quiebra al DNA y ala vez se va enroscando sobre el mismo mientras sintetice RNA. A la derecha, el núcleo enzimáticocon la pared anterior de las subunidades cortada para ver el interior, el timón es unaprotuberancia para fundir (separar las hebras) del DNA mientras se lee, el canal es la correderadonde pasa el DNA, hacia delante del mismo se halla el centro activo con un canal secundariodesde donde acceden los nucleósidos trifosfato (NTP) precursores del RNA.DNAcorriente arriba-35 -10promotorINICIOcorrienteabajoDNA enel canalSubunidad σ5´direcciónde lectura ysíntesisSubunidadSubunidad ρSubunidades αbolsillo Rifhendidura otimónsalida internadel canalsecundarioNTPMgcentro activo

Figura 6. Reconocimiento del moldeSubunidad σNúcleo de la enzimaFundido75 nucleótidostidos entrantes ya que puede incorporar fácilmenteanálogos de nucleótidos que no seaparean bien.El proceso de síntesis pasa por varias etapas:- El reconocimiento del molde (figura 6)consiste en distinguir el promotor medianteuna subunidad σ determinada (la más comúnes σ70, aunque hay otras para situacionesespeciales); σ fija el núcleo de la polimerasasobre un promotor clásico y ahí, este atrapaal DNA como si fuera una pinza.Las subunidades β y β´ dejan una hendidurao canal que actúa como guía del DNA.El DNA se funde, es decir sus hebras se separany forman una burbuja, mediante unmecanismo tipo cierre relámpago, ya que eltimón, una protuberancia que presenta la subunidadβ´, junto con el extremo C terminalde la subunidad β penetran entre los puentesde H interbases para separarlos. Un canalsecundario en la subunidad β sirve paraconducir los NTP necesarios al centro activoprovisto por la subunidad β´ y ubicado al fondodel canal guía. El centro activo contieneuna secuencia conservada que quela un ionMg2+ necesario para el mecanismo de formacióndel fosfodiester. Durante esta etapala polimerasa se apoya sobre unos 75 nucleótidos(desde -55 corriente arriba hasta+20 corriente abajo; ver también la figura 5).La iniciación (figura 7) consiste en poneren marcha el mecanismo catalítico. El DNAse abre aún más y se forma una burbuja detranscripción más grande, estabilizada por lapropia polimerasa, hecho que es seguido dela síntesis de una pequeña cadena de polinucleótiodos(entre 2 y 9) y la expulsión dela subunidad σ. Como la síntesis de RNA serealiza sin necesidad de cebo, se producenFigura 7. IniciaciónSeparación de σLiberación de pequeñospolinucleótidos(eventos abortivos)209

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